医院设有内分泌科、肾内科、神经内科、心血管内科、血液风湿免疫科、消化内科、血透内科、呼吸内科、肿瘤科、放疗科、肝胆外科、甲乳外科、泌尿外科、神经外科、胃肠外科、胸外科、创伤骨科、关节外科、脊柱外科、烧伤科整形外科、妇产科、儿科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、老年病科、皮肤科、中医科、感染科、康复医学科、重症医学科（ICU）、急诊科、手术室、病理科、CT室、放射科、功能科、供应室、核医学科、检验科、内窥镜中心、输血科、药剂科等临床科室和医技科室。

一、安徽省重点培育专科：重症医学科（ICU）、肿瘤科。

二、安徽省重点特色专科：肿瘤科、呼吸内科、骨科、神经内科、普外科、老年医学科、护理学。

三、黄山市重点专科：心内科、神经内科、肾内科、内分泌科、消化内科、血液风湿免疫科、胃肠外科、肝胆外科、甲乳疝外科、骨科、妇产科。

四、黄山市重点特色专科：儿科。

一、优势病种：呼吸衰竭、肺部感染疾病、糖尿病及各种急、慢性并发症、脑垂体疾病、甲状腺疾病、急慢性肾小球肾炎、肾病综合征、IgA肾病、尿路感染、脑血管病、癫痫、痴呆、脱髓鞘疾病、运动神经元病、各种贫血、骨髓增生异常综合征、急慢性白血病、淋巴瘤、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、急慢性胰腺炎、胃肠功能紊乱、直肠癌、小肠肿瘤、脾功能亢进、阑尾炎、肠梗阻、痔疮、肛裂、四肢与骨盆复杂骨折、骨不连、颈椎病、脊柱肿瘤、脊柱创伤。

二、优势技术：脑出血颅内血肿微创清除术、大量蛛网膜下腔出血行脑脊液置换疗法、经食道心房调搏术、经皮肤无创性心脏起搏、经皮肤无创性心脏起搏、经静脉临时心脏起博、血细胞分离技术、血浆置换术、胃肠道良性息肉高频电切除术、内镜下骨食道异物取出术、肿瘤化学治疗/靶向治疗/放射治疗/热疗、微创腹腔镜巨脾切除术、腹腔镜下左半肝及肝癌切除、主动夹层支架置入、乳腺癌保乳根治术、甲状腺癌颈清术、腔镜下胃癌根治术、结直肠癌根治术、人工肩关节置换术、人工髋/膝关节翻修术、盆腔淋巴结清扫、腹腔镜下腹膜代阴道术。